Deus Ex Human Revolution рассказывает о событиях, которые предшествовали оригинальной игре. Год 2027, то есть за 25 лет до Deus Ex. Главного героя Адам Дженсен, сотрудник службы безопасности (охранник в простонародье) компании Sarif Industries, лидер в производстве кибер-имплантатов. Прикрывшись толпой, выступающей против кибернизации населения, на штаб квартиру компании совершается спланированное нападение. Неизвестные кибернетически усовершенствованные агенты провоцируют полицейских открыть огонь по манифестантам. Цель штурма скорей всего прекращение исследований, которыми занимался научный персонал Sarif Industries. При нападении Адам был сильно ранен. Чтобы узнать, кто стоит за диверсией, Адам соглашается на процедуру усовершенствования имлантантами и начинает свое расследование.
Приблизительный перечень усовершенствований героя: само собой заменены руки, ноги, искусственные зрачки и мозговые усилители, вживлена броня.
У игрока в Deus Ex Human Revolution есть выбор, в каком режиме пройти: будь-то силовой метод, или стелс. При желании игру можно пройти вообще никого не убивая, кроме боссов. Здоровье регенерируется само, как и в большинстве современных игр, чтобы не испортить игровой процесс поиском аптечек.
